De Commandant Koninklijke Marechaussee voert het bevel over zo’n 9.000 mannen en vrouwen, zowel militairen als burgermedewerkers. De Staf Commandant Koninklijke Marechaussee is gevestigd in Den Haag. Hier wordt de strategie bepaald. Het Landelijk Tactisch Commando (LTC) zet de operationele eenheden van de Marechaussee op basis van informatie in waar ze nodig zijn. Onder de commandant van het LTC vallen de operationele brigades. De marechaussees worden opgeleid op het Opleidings-, Trainings- en Kenniscentrum (OTC) in Apeldoorn en op de Koninklijke Militaire Academie in Breda.
Beheer
De Marechaussee is een krijgsmachtonderdeel. De minister van Defensie is verantwoordelijk voor het beheer. Dat betekent dat de minister van Defensie de eindverantwoordelijkheid draagt voor zaken als personeel, materieel en financiën. De Marechaussee heeft ook een korpsbeheerder: de secretaris-generaal van Defensie. De korpsbeheerder is gemandateerd door de minister van Defensie.
Gezag
Het gezag over de Marechaussee ligt bij meerdere ministeries. De gezagsdragers bepalen hoe en wanneer de Marechaussee wordt ingezet. Afhankelijk van de taak zijn dat de ministeries van Justitie en Veiligheid (inclusief het Openbaar Ministerie en de Nationaal Coördinator Terrorismebestrijding en Veiligheid), Buitenlandse Zaken, Binnenlandse Zaken en Koninkrijksrelaties en Defensie.